嬰幼兒眼疾的可能原因，可分為先天性及後天性兩大類。其中先天性因素包括產道感染、遺傳、代謝異常、早產、或不明原因等。後天性的因素則包括有藥物、營養不良、感染、眼部外傷、毒性物質、放射線物質的副作用等。以下是常見的嬰幼兒眼疾：

感染性眼疾
如果感染發生於胚胎發育期，尤其是前三個月，會嚴重影響眼球的結構，造成重大眼球異常，因此，想要懷孕的婦女最好能事先多做健康檢查加以預防治療。常見感染性眼炎如下：
（1）新生兒眼炎
成因：新生兒出生時，因為經母親產道時受披衣菌感染，所引起的結膜發炎。
症狀：出生後5〜14天可見黏液化膿性分泌物，以及以及乳突狀結膜炎。
治療：塗抹眼藥膏、藥水及口服紅黴素持續14天。
（2）淚囊炎
成因：鼻淚管阻塞
症狀：常有淚眼汪汪、溢淚的情形。
治療：先控制感染，並以按摩或手術治療先天性鼻淚管阻塞。一般出生六個月內會好，如果到周歲情況仍沒有好轉，可能需要用手術治療。

遺傳性眼疾
成因：遺傳性眼疾主要是因為染色體上基因發生病變，如果合併有全身症狀，將無法有一般正常人的壽命。
常見遺傳性眼疾：無虹膜症、視網膜色素變性症、先天性白內障、小眼症、白化症、色盲、脈絡膜缺失症等。
治療：大多無法治療。

早產兒視網膜病變
成因：因血管發育不完全，導致異常新生血管增生，容易造成玻璃體出血以及視網膜玻璃，嚴重者會導致失明。
預防：早產兒出生後四〜六週起，需定期接受視網膜檢查，採取適當治療，才能預防失明。
治療：有大部分可自然發育完成，不治而癒。其病程可分為五期，第一〜二期不需治療，只有在病情進行到第三期，才需要冷凍治療或雷射光凝固治療，第四〜五期雖可手術治療，但視力預後仍然很差。

正常結構變異的眼疾
最常見的是下眼瞼贅皮導致的睫毛倒插。
成因：下眼瞼贅皮過多。
症狀：寶寶會有眼睛刺痛、畏光、易流淚、喜歡揉眼睛，甚至因揉眼動作過劇導致角膜上眼皮破損或反覆糜爛。
治療：嚴重時需及早用眼瞼手術加以矯正。

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